El Bachillerato inició sus actividades en agosto de 1982, en las instalaciones del Instituto Cuauhtlatóhuac, con el P. Manuel Ruiz Ugalde como Director. En agosto de 1984 se trasladó la preparatoria a Playas de Tijuana. El 1988 el Dr. Carlos Escandón, S.J., Rector de la UIA Cd. de México, juzgó conveniente unir bajo una misma dirección la Universidad Iberoamericana Noroeste y el Bachillerato, quedando como Rector y Director el P. Agustín Rozada R., S.J. En 1997 se colocó la primera piedra para la construcción del actual edificio. En 1998 se inició el ciclo escolar en las nuevas instalaciones. En 2010 se dio la apertura de la Secundaria Ibero Tijuana, siendo Director General, tanto del Bachillerato como de la Secundaria, el P. Juan José Esquivias L., S.J. En el 2014 se nombró al Lic. Antonio Oseguera Maldonado S.J.

Formar hombres y mujeres útiles, con espíritu de justicia y de servicio.

LLegar a ser en el 2015 una comunidad consolidada y referente.