Abrió sus puertas en 1926, con el nombre de San Luis Gonzaga. En 1972, con acuerdo de la Compañía, se creó la Asociación Civil Instituto San Luis Gonzaga, formada por padres de alumnos que asumieron la responsabilidad de continuar el proyecto educativo. En adelante, el Colegio será asociado´ a la Compañía. En 1997 el Colegio se hizo mixto. En 2009 la Asociación Civil reestructuró el gobierno del establecimiento, creando una conducción colegiada: a las tradicionales direcciones de nivel inicial / primaria y secundaria, se sumaron una Dirección de Pastoral y un Rectorado General.

SOMOS una comunidad educativa que, atendiendo al contexto urbano en el que está enclavada, trabaja para lograr aprendizajes y formación de calidad en todos sus estudiantes, inspirados en el Evangelio de Jesús y la Espiritualidad Ignaciana.

DESEAMOS Y ELEGIMOS ser una comunidad eclesial, alegre y trabajadora, que respetando y valorando la diversidad, busca la excelencia en el servicio que realiza y promueve la cultura del encuentro DESEAMOS Y ELEGIMOS ofrecer a nuestros estudiantes una formación integral que les permita ser ciudadanos alegres, libres, conscientes, competentes, compasivos y comprometidos, líderes en el servicio con y para los demás.