A instancias del P. Mario Rodríguez, los jesuitas, con la ayuda de familias locales, fundan el San Javier en 1954, un colegio de varones con pupilado. Desde 1977 es mixto y desde 1980 ya no hay pupilado. Sus rasgos son: impronta de servicio, acompañamiento, amistad, deporte y disciplina. Desde 1957 colaboran en primaria las Misioneras del Sagrado Corazón de Jesús y de María. Jesuitas y misioneras asumieron funciones directivas y docentes que hoy en su mayoría son llevadas por laicos, reservando a los religiosos la pastoral y la inspiración ignaciana. Desde 2009, junto al Rector jesuita, hay una laica en la Dirección General.

El Colegio San Javier, abierto al servicio en particular de la propia comunidad tacuaremboense y en diálogo con las culturas establecidas y emergentes, procura responder a su identidad de institución católica arraigada en la tradición ignaciana,haciendo de la atención personal una característica básica, tal como distingue a los colegios de la Compañía de Jesús. Dada su naturaleza y cometido específicos, en nuestra institución procuramos educar a nuestros alumnos y alumnas respondiendo a las distintas etapas de su desarrollo psico-físico-espiritual desde nivel inicial hasta bachillerato, ayudando a que se sientan agentes de su propio aprendizaje y logrando un proceso de educación integral, de modo que amen a los demás y a sí mismos y desarrollen las cualidades, habilidades y capacidades que los dispongan para enfrentar los desafíos de un mundo en cambio continuo. Para ello, procura formar.

La visión que deseamos alcanzar Convivencia: o Nuestra institución forma en una mentalidad y un modo de actuar solidario. o Forma una comunidad educativa que con realismo se va construyendo de continuo. o Crea un clima de convivencia y genera actividades que hace que los alumnos se sientan a gusto en la institución, entendiendo con todo que los conflictos forman parte del proceso educativo. o Construye la unidad entre los diferentes niveles desde la identidad de cada uno. Dimensión religiosa: o Forma en una fe cristiana comprometida, ilustrada, y celebrativa, que dialoga con la ciencia y la cultura y es respetuosa de otras creencias. Aspectos pedagógicos: o Cultiva el aprendizaje a través de la investigación. o Todas las actividades que promueve o acompaña son valiosas en sí mismas, a la vez que tienen una finalidad educativa o Brinda los apoyos necesarios y suficientes.